Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C18orf8Q96DM3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms