Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTHRC1Q96CG8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms