Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFHD2Q96C19 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD2Q96C19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms