Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3DQ96BQ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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