Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EME1Q96AY2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms