Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RFT1Q96AA3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms