Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TP53INP1Q96A56 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms