Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYAP1Q96A49 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYAP1Q96A49 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms