Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3Q969T4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms