Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC38A4Q969I6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms