Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CAVIN3Q969G5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN3Q969G5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms