Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCAMP4Q969E2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms