Protein–RNA interactions for Protein: Q92925

SMARCD2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2Q92925 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD2Q92925 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCD2Q92925 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms