Protein–RNA interactions for Protein: Q92597

NDRG1, Protein NDRG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG1Q92597 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NDRG1Q92597 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NDRG1Q92597 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDRG1Q92597 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms