Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PHF3Q92576 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHF3Q92576 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHF3Q92576 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PHF3Q92576 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF3Q92576 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF3Q92576 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF3Q92576 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF3Q92576 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF3Q92576 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF3Q92576 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PHF3Q92576 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF3Q92576 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF3Q92576 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF3Q92576 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF3Q92576 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PHF3Q92576 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF3Q92576 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF3Q92576 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF3Q92576 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF3Q92576 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF3Q92576 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF3Q92576 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF3Q92576 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF3Q92576 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF3Q92576 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF3Q92576 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF3Q92576 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF3Q92576 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF3Q92576 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF3Q92576 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF3Q92576 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHF3Q92576 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF3Q92576 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF3Q92576 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF3Q92576 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF3Q92576 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF3Q92576 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF3Q92576 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF3Q92576 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF3Q92576 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF3Q92576 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHF3Q92576 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF3Q92576 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF3Q92576 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF3Q92576 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF3Q92576 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF3Q92576 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF3Q92576 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF3Q92576 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF3Q92576 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF3Q92576 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF3Q92576 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF3Q92576 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms