Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF4Q92544 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms