Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4AQ8WYN0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms