Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH5

SOCS4, Suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4Q8WXH5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOCS4Q8WXH5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms