Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD4Q8WVF5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms