Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV35

LRRC29, Leucine-rich repeat-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC29Q8WV35 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC29Q8WV35 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC29Q8WV35 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LRRC29Q8WV35 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC29Q8WV35 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms