Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEE9

SAP25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP25Q8TEE9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAP25Q8TEE9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAP25Q8TEE9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms