Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GNPDA2Q8TDQ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms