Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPPL3Q8TCT6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPPL3Q8TCT6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPPL3Q8TCT6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPPL3Q8TCT6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPPL3Q8TCT6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPPL3Q8TCT6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms