Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STAG3L4Q8TBR4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAG3L4Q8TBR4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms