Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH3Q8TBE1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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