Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KLHDC4Q8TBB5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHDC4Q8TBB5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KLHDC4Q8TBB5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KLHDC4Q8TBB5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms