Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO3Q8TAP4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms