Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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RHOXF1Q8NHV9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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RHOXF1Q8NHV9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOXF1Q8NHV9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHOXF1Q8NHV9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOXF1Q8NHV9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOXF1Q8NHV9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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