Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEDD1Q8NHV4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEDD1Q8NHV4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms