Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYRIPQ8NFW9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms