Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BEST4Q8NFU0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms