Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C17orf47Q8NEP4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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