Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM46DQ8NEK8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46DQ8NEK8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms