Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC150Q8NCX0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC150Q8NCX0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms