Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPRQ8NCN5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDPRQ8NCN5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDPRQ8NCN5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDPRQ8NCN5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms