Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms