Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FSIP1Q8NA03 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms