Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO5AQ8N6Q1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms