Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC155Q8N6L0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms