Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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