Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMYD4Q8IYR2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMYD4Q8IYR2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms