Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXL7

MSRB3, Methionine-R-sulfoxide reductase B3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB3Q8IXL7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRB3Q8IXL7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MSRB3Q8IXL7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRB3Q8IXL7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms