Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM48Q8IWZ4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms