Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKL3Q8IVW4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL3Q8IVW4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms