Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL1Q8IU54 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
IFNL1Q8IU54 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms