Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DZIP3Q86Y13 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
DZIP3Q86Y13 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms