Protein–RNA interactions for Protein: Q86WN2

IFNE, Interferon epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNEQ86WN2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNEQ86WN2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNEQ86WN2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms