Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5Q86VQ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms