Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SYT9Q86SS6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT9Q86SS6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms