Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms